闻之师云：修行法门有二种：一从法界归摄色身，一从色身透出法界。从法界摄色身，《华严》尚矣；从色身出法界，《愣严》诸经有焉。《圭旨》所陈，大都从色身而出者。夫果出法界矣，方且粉碎虚空，有甚身心可论。因指见月，得道忘诠，是在善修者自契。
居士流通之意，无变见及此欤？予不负其流通善念，并思鸣氏宝藏初心，遂述缘起，质之有道。
万历乙卯（1615年）夏仲新安震初子余永宁常吉书
“缘起”说有几层意思：其一，第一段指“是书出尹真人高弟手笔，盖述其师之意全演之。中间所载诸图及说及修行节次功夫，可谓详尽矣。”（序：题尹真人《性命圭旨全书》）其二，第二、三段谈法界和色身的关系，道出了前面徐海印“《性命圭旨》十二大错”的立论错误所在；其三，未段是还愿，还丰干居士流通之意和思鸣氏藏宝初心，用“无亦见及此彼”和“初心”之词，怀念两位的善举。
自1615年“缘起”，回到《性命圭旨》全部刻成，需要若干年；丰干居士绘图立论、寻诀摘谒，又要若干年；加之思鸣氏古本又“藏之有年”，《性命圭旨》成书最早出现的时间，应在1615年前再加不应超过百年，在明嘉靖（1522～1566年）到万历（1573～1620）之间，或嘉靖末年到万历初年之间。
三、《性命圭旨》的哲理性
《性命圭旨》先从口诀、功法、理说、图文发展成为道教内丹养生的根据，对道及万物的存在及性质都作了阐述，特别是理说阶段的哲理性说明，在书中充分表现了出来。本文试从元集前“四说”和其它理说，亨、利、贞集寻找出它的哲理性。
1、大道说
中国传统哲学言“道”，是指大道，即“天、地、人合一”之“一”，大道有无极、太极之生机，太极有生万物、归无极之玄理。
《性命圭旨》所讲的道，指不生不灭，永恒存在的物质性本源——炁。炁是道教一个特别重要的概念，它是气，但它不是天地剖判之后的阴阳二气，也不是构成具体事物的与形式相对的质料，更与《管子》的精气有别。炁指世界本源，万物从它产生，最后还归于它，它不像阴阳二气具体，也没有质料那样抽象，更没有精气那样多的精神性。它是天地万物的本源，它无始无终，处处充满，它中间潜藏着后来发展的种子，它细入微尘也苞通天地。（引自《明代哲学史》第670页）
故《性命圭旨》“大道说”中有：
夫道也者，位天地、育万物，曰道；揭日月、生五行，曰道；多于恒河沙数，曰道；孤则独无一侣，曰道；直入鸿蒙而还归溟滓，曰道；善集造化而颉超圣凡，曰道；目下机境未兆而突而灵通，曰道；眼前生杀分明而无能逃避，曰道；处卑污而大尊贵，曰道；居幽暗而极高明，曰道；细人刹尘，曰道；大包天地，日道：从无入有，曰道；作佛成仙，曰道。佛经五千四十八卷，也说不到了处；中庸三十三章，也说不到穷处；道德五千余言，也说不到极处。道也者，果何谓也？一言以定之，曰炁也。
《性命圭旨》的“大道说”分了几个层次进行说明：
第一，先明“炁”之道。“庖羲上圣，画八卦以示人，使万世之下，知有养生之道。”此道为“炁”，“炁”在道教宇宙发生论的几个阶段，有不同的状态描述，有 “太乙”、“无始”、“元始”、“太极”、“混元”、“六合”。如果用老子表示天地生成的阶段“道生一，一生二，二生三，三生万物”说，太乙为道，太易为道生一，太极为一生二，混元为二生三，六合为三生万物，“炁”之道，出于练丹和养生的目的探讨天地万物的本源。
第二，后示人之道。人的生长发育诸阶段，人的各阶段的生理心理特征，是炼养的重要参照，也是它讨论性命的重要依据。人道的修炼，在乎性命，“故三教圣人，以性命学开方便门，教人熏修，以脱生死。”性命之学，成就真人。故《性命圭旨》对“人道”的理说有：
人禀氤氲之气而生，而长至于二八之年。则九三之阳乃纯。当是时也，岂非上德之大人乎？忽天一朝，谋报浑敦之德者至，乃日凿一窍，则九三之阳，蹄骤奔蹶，而去之六二之中矣。由是乾不能纯，而破于离；坤有所含，而实于坎。
