拉肚子对人体的损害很大，即便是身体壮硕的大汉也架不住拉肚子的危害。不管是人为的还是因病拉肚子，都会使人体虚弱。拉肚子会大损人体的正气，练习洁肠法后人会感到中气不足，吊气，全身无力，双腿发软。
瑜伽洁肠法的关键在于喝下的盐水的浓度和数量，和做那几个瑜伽体式没有多大关系。如果喝下的盐水浓度和数量都足够，不做体式也会拉肚子；喝下的盐水的浓度和数量不够，再怎么做体式也不会拉肚子。还有一种说法是，如果有消化道疾病，例如胃或者十二指肠溃疡，就不能喝盐水，要用温开水来代替。这是想当然的说法，便秘患者和体内有宿便者，喝下再多的温开水，做再多的体式，也只会排尿，不会排便。
有些练习瑜伽洁肠法的人，对洁肠法形成了依赖。这是一种恶性循环，练习瑜伽洁肠法，暂时性的排出了大便，却破坏了肠道的功能，结果造成更严重的问题，于是再用瑜伽洁肠法来解决
用瑜伽洁肠法来帮助排便排毒，是饮鸩止渴的方法，并不可取。
