③基于分子杂交的方法有1篇，主要针对重复序列。
有的报道中同时使用两种方法，如同时使用ITS序列分析与RAPD、PCR―RFLP和RAPD等。根据各个文献发表时间及其使用的方法可以得到人参类药材分子鉴定的发展特点：
①随机引物虽占据主导地位，但随着时间的推移，RAPD等方法逐渐推出舞台。无须预先知道基因组信息的特点，使RAPD在中药材分子鉴定上成为最主要的方法，但随着18S、matK基因的测序，新方法便得以诞生，如MARMS。同时，在RAPD基础上发展起来的方法也显示了极好的应用前景，如SCAR标记以及应用梯度PCR检测中药复方中人参的PCR引物均是从RAPD的特异条带中得到的。
②序列分析是各种新方法应用的基础。植物核基因组中的rDNA是研究最为广泛的基因之一，其中18S、ITS以及5S已成功的应用与人参西洋参的鉴别，可以直接利用测序后的碱基变异作为鉴别指标也可以利用等位基因PCR直接检测变异位点，从而通过电泳就可达到准确的鉴别。等位基因PCR简单、快捷、目标明确，有非常大的推广应用价值。此外，叶绿体基因中的编码间隔区正逐渐成为分子系统学研究的热点，如参类药材对叶绿体基因中的matK以及trnC-trnD进行了测序。
③简单、快捷、准确是分子鉴定发展的趋势。参类药材分子鉴定的历程基本是随机引物―序列分析―PCR-RFLP―AFLP―特异引物PCR，体现了由复杂向简单的过程。近两年来，特异引物的应用以及在复方中参类药材的成功检出，标志着参类药材的鉴定达到了十分完美的地步。但这些仅仅解决了药材的“真伪”问题，质量的“优劣”却仍然没有很好的方法，如山参与栽培人参、朝鲜人参与中国人参、美国西洋参与中国引种栽培西洋参的鉴别为我们提出了新的课题。
