洪武二十五年(1392年) 来复撰《淳拙禅师道行之碑》，日该国沙门德始书丹。
弘治十四年(1501年) 西天梵僧受古梅住持之请，任少林寺劝缘僧。
正德五年(1510年) 文载住持少林寺，奉行《禅苑清规》，计十二年。
正德七年(1512年)霸州农民刘氏起事，少林寺武僧奉命征伐。此年，建立雪亭。
嘉靖元年(1522年) 十一月，山东清州矿丁王堂起事，少林寺武僧奉命征伐。次年乃败。
嘉靖二十七年(1548年) 为武僧三奇周友立塔，敕名“天下对手，教会武僧”。
嘉靖三十一至三十三年(1552-1554年) 少林寺武僧三十多人奉命赴沿海抗击倭寇，英勇壮烈。
嘉靖三十二年(1553年)柘城盐徒师尚诏起义，少林寺武僧竺方周参等奉命征讨，十月，师尚诏伏诛。
嘉靖三十四年(1555年) 徽王府为少林寺修建牌坊，徽王朱载埨书丹。次年，朱载埨因罪自杀，徽府除国。
嘉靖三十七年(1558年) 小山住持少林寺，计八年。
嘉靖四十年(1561年) 抗倭名将俞大猷至少林寺观武，认为“真诀皆失”，选寺僧宗擎、普从随其学习棍法。
嘉靖四十二年(1563年) 西天梵僧弟子扁囤和尚圆寂。
嘉靖四十四年(1565年) 郑王之子朱载堉立《混元三教九流图》于少林寺。
隆庆间(1567-1572年)程宗猷入少林寺习武，近十年。晚年刊《少林棍法阐宗》等行世。
万历二年(1574年) 常润主持少林寺。
万历五年(1625年) 河南巡抚程绍在少林寺观武，作《少林观武》诗。
万历十六年(1588年) 创建千佛殿，贮神宗母李太后所颁续刻藏经。
万历三十七年(1609年) 无言主持少林，计十七年。袁宏道游少林，观武。
万历四十一年(1613年)杭州人陈元赟入少林寺习武。1683年东渡日本，传少林拳棍于日本。
万历四十七年(1619年) 为都提举、征战有功万安同顺、授教师本乐宗武立塔。
崇祯十一年(1638年) 登封农民李际遇起义。
