新生儿防疫，主要是接种卡介苗和乙肝疫苗。
宝宝出生第二天即可接种卡介苗。
接种后，可获得抗结核菌的一定免疫能力。卡介苗接种一般在左上臂膊三角肌处皮内注射，也有在皮肤上进行划痕接种，做“一”字或“#”字形，长一厘米。划痕接种法虽然方便，但接种量不准，有效免疫力不如皮内注射法。因此现在一般不采用划痕法。
新生儿接种卡介苗后，无特殊情况，一般不会引起发热等全身性反应。接种后2～8周，局部出现红肿硬结，逐渐形成小脓疮，以后自行消退。有的脓疮穿破，形成浅表溃疡，直径不超过0.5厘米，然后结痂，痂皮脱落后，局部可留下永久性疤痕，俗称卡疤。为了判断卡介苗接种是否成功，一般在接种后8—14周，应到所属地区结核病防治机构再作结核菌素(OT)试验，局部出现红肿0.5—1.0厘米为正常，如果超过1.5厘米，需排除结核菌自然感染。一般新生儿接种卡介苗后，2～3月就可以产生有效免疫力，3～5年后，或在小学一年级时，再做OT试验，如呈阴性，可再接种卡介苗一次。早产儿、难产儿及有明显先天畸形、皮肤病等病症的新生儿，禁忌接种。
我国乙肝免疫接种已在新生儿中广泛应用。整个免疫注射要打三针。第一针由产科婴儿室医护人员注射，宝宝出生后24小时内，在上臂三角肌处注射，剂量1 0微克。第二针在出生后一个月注射，剂量1 5微克。第三针在出生后六个月注射，剂量为5微克。全部免疫疗程后，有效率可达90%～95%。婴幼儿接种疫苗后，可获得免疫力达3～5年之久。
免疫疫苗接种过程简单，一般不会有什么反应。个别宝宝可能出现低热，有的在接种部位出现小块的红晕和硬结，一般不用处理，1～2天会自行消失。
了解新生儿的免疫知识，对于宝宝应当在什么时候再打防疫针，做父母的可以心中有数，一般说来，医院给宝宝的健康卡上会介绍相关知识，如果没有健康卡的，一定要到当地儿童防疫部门多问一问，了解相关知识，为宝宝做好各种健康防疫接种，防患于未然。
