如果三焦经的经气出现异常，通常会导致耳聋，耳后疼痛，咽喉肿痛，目外眦痛，面颊肿痛，肩、臂、肘外侧疼痛，小指次指不能用，腹胀，水肿，遗尿，小便不利等疾症。因为手少阳三焦经脉和其支脉，是从膻中穴上行出缺盆穴，上项系耳后，出走耳前，交于颊部，至目外眦。所以，三焦经如果出现异常，则经气不利。手少阳三焦经起始于小指、次指的指端，上出两指之间，循手至腕，出于臂外两骨之间，上贯肘，循脯外，上肩、经脉有病，则肩、臂、肘外侧疼痛，小指、次指不用。三焦主持诸气、疏通水道、输布水液。三焦气机不畅，则腹胀，气化不利水液泛滥则水肿：膀胱气化失司则遗尿、小便不利。
通过调理三焦经，对于侧头、耳、目、胸胁、咽喉病，热病，以及经脉循行部位的其他病症，如腹胀，水肿，遗尿，小便不利，耳鸣，耳聋，咽喉肿痛，目赤肿痛，颊肿，耳后、肩臂肘部外侧疼痛等症，具有良好的疗效。
手少阳三焦经是调和脏腑的经脉，平时可以顺着经脉的走向拍打，以强化三焦经，同时还有理气、和胃、散寒的功效。还可以用按摩、拔罐、刮痧、艾灸的方法打通经络，能治疗偏头痛、手臂痛。练习瑜伽中的拜月式和八段锦可以锻炼手少阳三焦经，预防肩颈僵硬、胸闷。
