发酵是炮制方法之一。指药物在一定的温度和湿度条件下，由于微生物和酶的催化分解作用，使药物发泡，产生黄白色霉衣的方法。一般发酵的最佳温度在30～37℃，相对湿度控制在70％～80%为宜。多利用空气中微生物自然发酵，但有时会因菌种不纯，影响发酵的质量。通过发酵可以制造新药，产生新的治疗作用。常用干六神曲、建神曲、半夏曲、淡豆豉等药物的制备。
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