多数非致死性畸形不需要在孕期进行外科干预，如先天性心脏病等，可在出生后进行手术治疗。但部分胎儿畸形可能影响胎儿的宫内安危，需要在孕期进行干预。
胎儿镜治疗：目前主要应用于治疗双胎输血综合征，国外有报道用于治疗脑脊膜膨出微创治疗，胎儿镜试管超声检查等。
射频消融治疗：主要应用于单绒毛膜双胎减胎术等。
胎儿开放外科：一般意义上的胎儿开放外科指在妊娠中期开放宫腔，在直视情况下对胎儿进行手术治疗，然后继续妊娠的治疗方法。主要治疗可能影响胎儿宫内安危及新生儿的健康的畸形:如先天性膈疝，肺囊腺瘤、脊柱裂等。多在国外报道，国内因文化差异等原因，开展较少。并且其手术指征、效果及预后仍有待进一步探讨。
