包括“伤寒”和“杂病”两部分内容。
伤寒部分(即《伤寒论》)，按该病起始为发热的特征，分成六种证候类型，即三阳(太阳、少阳、阳阴)、三阴(太阴、少阴、厥阴)，三阳表示热实，三阴表示寒虚。根据病邪侵入肌体程度、病势缓急，用四诊(望、闻、问、切)，八纲 (阴、阳、表、里、寒、热、虚、实)，辨证施治确定病情。
六经病证各有主治方，按汗、吐、下、 和、温、清、 补、消，结合《内经》有关正治、反治、异病同治、同病异治各种治则，共包括397法、113 方。其中方剂如麻黄汤、桂枝汤、白虎汤、小柴胡汤等，方简意明，具有临床实际效果，便于学者掌握。
杂病部分(即《金匮要略》)主要论述伤寒以外的各种内科疾患，如痉、湿、□、中风、历节、血痹虚劳、肺痿、 肺痈、咳嗽、胸痹、 心痛、短气、腹满、寒疝、风寒积聚、痰饮、 消渴、黄疸、惊悸、 吐衄、呕、吐、哕、下利，以及一些外科疮痈、妇女妊娠和各种杂疗急救症治。
这部分论述不以六经论治，而是根据病证按脏腑病机辨证治疗。各类杂病，均有主方。同时讲求药物配伍。一些方剂，除汤、散、丸外，还有酒、熏、洗滴等多种疗法。
