秋季腹泻通常的治疗方法主要是调整饮食，只要没有剧烈的呕吐，宝宝大多不用禁食。对于已经添加辅食的宝宝，可暂缓增加新的食物，原来吃过的还可以继续喂。腹泻期间宝宝容易出现继发性乳糖不耐受，使腹泻时间延长，必要时需要暂时更换不含乳糖的婴儿配方奶粉，腹泻好转后可以再恢复正常的配方奶和母乳喂养。对剧烈呕吐的宝宝需要禁食4～6小时后开始逐渐增加喂食。
预防脱水也是秋季腹泻和其他各种腹泻很重要的治疗环节，要按少量多次的原则给宝宝增加饮水（主要是白开水）。当宝宝因为腹泻次数多，出现脱水症状，或已经被诊断为轻、中度脱水时，一般要给他用口服补液盐，对于中度以上脱水或吐泻严重的则需输液。这些措施可以及时纠正脱水、电解质及酸碱平衡紊乱。
秋季腹泻治疗方法还包括使用肠粘膜保护剂和微生态制剂。肠粘膜保护剂（如蒙脱石粉）能吸附病原，固定毒素，然后随大便排出体外。同时，这种保护剂还能加强胃肠粘膜屏障功能，促进肠粘膜的修复。不过，如果你给宝宝服用，一定要严格按照产品说明，不要过量，否则容易导致便秘。如果宝宝还要同时服用其他药物，则需要间隔一段时间后再服用。当你有任何不确定的地方，一定要向医生咨询。
微生态制剂能补充肠道正常菌群，恢复微生态平衡，重建肠道天然生物屏障保护作用。常用的有双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、粪链球菌、蜡样芽胞杆菌制剂。此外，你也可以带宝宝去看中医，采用中药治疗。
