各种疫苗均具有一定的保护率，由于受种者个体的差异，少数人接种后不产生抗体，仍有可能会感染病毒。另外，如果接种疫苗时受种者，恰好已处在该疫苗所针对疾病的潜伏期，接种后疫苗不能产生保护作用。
婴儿时期接种乙肝疫苗最好
研究发现，接种乙肝疫苗后产生乙肝表面抗体的情况，还与受接种者的免疫状态、性别、年龄、种族及营养状况等许多因素有关。
婴儿对疫苗产生抗体和保护效果的能力比成人强而迅速，年青人比老年人的接种效果好；女性同剂量、相同条件接种疫苗后，乙肝表面抗体转阳率比男性要高；有免疫缺陷的机体对乙肝疫苗的应答能力明显降低。
接种了乙肝疫苗并不是“万事大吉”
注射乙肝疫苗是目前预防乙肝的有效措施，不过，许多因素可影响乙肝疫苗的预防效果，因此不能掉以轻心，排除影响接种乙肝疫苗成功的因素要注意以下二点：
1、被动吸烟：有关的调查发现，被动吸烟的儿童体内抗体水平下降较快，虽然接种了乙肝疫苗，但是抗体达不到足够的数量，当然也就无从有效的阻止乙肝病毒的入侵。
2、挑食：挑食的儿童常常有某些营养缺乏，使机体免疫反应功能降低，体内产生的抗体有限，因而易受乙型肝炎病毒的感染。另外，调查发现肥胖儿童感染乙型肝炎的几率是正常儿童的3.5倍，所以要控制下孩子的体重。
