中枢性疾病
卵巢能够正常排卵，受下丘脑—垂体—卵巢生殖轴功能的正常反馈与调节，而下丘脑是主管生殖轴的“司令部”，司令部如果出现问题，如患过脑炎、头部外伤，出现Kallmann综合征，则可能引起女性月经失调，不排卵，闭经等症状。
垂体性疾病
垂体病变如垂体腺瘤，高泌乳素血症等问题，会引发女性闭经及卵巢排卵异常。
卵巢自身因素
先天性卵巢发育不全，多囊卵巢综合症、卵巢功能早衰，卵巢巧克力囊肿、功能性卵巢肿瘤等影响卵巢排卵。而卵巢巧克力囊肿不但会破坏卵巢组织，影响排卵，还可造成严重粘连而致女性不孕。
甲状腺、肾上腺皮质功能异常引起的排卵障碍
如甲亢、甲减、肾上腺皮质功能亢进、柯兴氏综合征、肾上腺皮质肿瘤、肾上腺皮质功能低下等，会导致下丘脑—垂体—卵巢生殖轴功能的正常调节，继而影响女性排卵。
全身性疾病
过度减肥，严重的缺乏营养，过度肥胖或饮食中缺乏某些维生素等，导致生殖轴调节紊乱、内分泌失调而影响卵巢排卵功能。重症糖尿病等也会影响卵巢排卵障碍，导致女性不孕。
心理问题及情绪紧张
临床中不难发现很多有着排卵障碍的女性，都或多或少存在着焦虑、急躁、情绪紧张等问题，而这些问题的存在也是间接导致不排卵的原因。在诊疗中发现，有很多不排卵的女性在放松下来之后，反而能够自然排卵了。
