和比正常生产的宝宝的相比，剖腹产新生儿的免疫力及抗感染能力相对较差。由于剖腹产新生儿的脐血中，免疫球蛋白含量比自然分娩的新生儿要低，能抗病的抗体含量更低。所以，剖腹产的新生儿更易感染疾病。
控制免疫球蛋白合成的基因(主要用于增加人体免疫力)，位于人体X染色体中，而女性的这种染色体比男性要多一个，因此，女婴的免疫力比男婴强。 对阴道分娩和剖腹产分娩的新生儿脐静脉血补体含量进行比较，其中，阴道分娩组新生儿脐血免疫球蛋白含量明显高于剖宫产组，原因是阴道分娩新生儿的免疫球蛋白是在临产时，尤其是通过产道时，由于受到宫缩的挤压而从母体获得。
剖腹产可降低新生儿免疫力及抗感染能力，增加新生儿感染的机会。因此专家建议，在条件允许的情况下，产妇最好自然分娩，这样更有利于新生儿健康。
