丙肝的传播途径很多，而且和艾滋病有很多相似之处。首先是通过血液传染。如果在输血或血液制品过程中使用了感染病毒的血液，就有被传染的可能。但是随着我国从1993年开始实施血源管理，使得通过血液途径新发的丙型肝炎病人已得到明显控制。另外，丙肝也可以通过体液传染。
在日常生活中，有一些高危行为会使人更易感染丙肝，比如：在卫生条件不够的地方文身；在消毒不规范的小诊所或医院接受牙科治疗或做胃镜；在卫生不合格的理发店刮胡子；进行同性性行为和吸毒。这些生活方式都有可能增加感染的概率。
目前，丙肝和艾滋病共生的问题引起了很多医务人员的忧虑。丙型肝炎病毒和艾滋病毒都可以经血液或注射途径传播。即都是经由血液感染，感染初期没有明显的症状。在美国艾滋病毒感染者中高达30%的人同时感染丙肝，欧洲的这一数据是33%。单纯丙肝感染者通常要通过20-30年的时间最终发展成诸如肝硬化和肝癌这样的晚期肝病。然而重叠感染者体内的丙肝病毒浓度会更高，病毒恶化的速度更快，是仅仅感染丙肝病毒者的7倍。
近年北京地区的艾滋病病毒感染者正在以年均50%的速度递增，其中最主要的感染途径是共用注射器吸毒。60%的吸毒者是艾滋病病毒感染者。目前慢性丙型肝炎已经成为威胁艾滋病人并导致其死亡的首要原因。同时感染丙型肝炎病毒的艾滋病患者由于治疗的难治性和复杂性，正越来越受到重视。
