鱼油则是深海鱼类脂肪的提取物，属于油脂类，也是具有微弱鱼腥味的油状液体，但是其成分与鱼肝油截然不同，内含有ω(欧米加)-3脂肪酸(属多不饱和脂肪酸)，包括二十碳五烯酸(简称EPA)和二十二碳六烯酸(简称DHA)，这些物质能降低人体血液中低密度脂蛋白胆固醇(又称坏胆固醇)、甘油三酯，升高高密度脂蛋白胆固醇(又称好胆固醇)，从而防止动脉粥样斑块形成，并且通过影响体内其他物质代谢阻止血小板凝聚，防止血栓形成。DHA还可以通过血脑屏障，对神经传导有重要作用，是良好的健脑物质。
由此可见，鱼油和鱼肝油对人体的保健作用大不相同，服用时千万不能混淆，更不可相互取代。鱼油服用量较大，如果以相同的量服用鱼肝油，势必产生蓄积中毒，小儿服用鱼肝油过量造成维生素A中毒。维生素D中毒，临床上并不少见，不可掉以轻心
将鱼油当做鱼肝油吃，由于深海鱼油属于食品，食用后虽无副作用，却会延误应有的治疗(如刘大爷老伴后来发展成为角膜软化症)。反过来，如果将鱼肝油当鱼油吃影响可大了，如上所述会造成蓄积中毒。
