以下是几种腹泻的可能原因：
1、病毒感染
这是导致腹泻最普遍的原因。入侵的病毒可能损害小肠内壁的黏膜，扰乱养分及水分的吸收。症状通常会在1～3天之内改善，腹泻的情形会逐渐消失。
2、过量咖啡因或酒精
咖啡因及酒精会刺激粪便的通过饮用过量可能会导致食物太快通过小肠及大肠，造成腹泻。
3、细菌感染
污染的食物或饮水之中的细菌会形成毒素，导致小肠细胞分泌盐分与水分，超乎小肠后段及大肠吸收水分的能力，这种腹泻会持续1～3天。其他发炎因子寄生虫或抗生素等药物反应
这也可能导致腹泻，幸好这种状况并不普遍。一旦寄生虫消灭或是停止使用抗生素，腹泻的状况就会消失。
小肠失调持续或是经常复发的腹泻可能与小肠失调有关。可能的原因包括肠激躁症候群、溃疡性结肠炎及克隆氏症等发炎性疾病，或是吸收障碍，例如乳糖不耐症或是乳糜泻。肿瘤有时也可能导致腹泻。
