经络调节作用
经络学说是祖国医学重要内容，也是灸疗的理论基础。
艾灸涌泉穴相协调的，这种相互协调关系，主要是靠经络的调节作用实现的。
现代研究表明经络腧穴具有三大特点：
1、经络腧穴对药物具有外敏性即用同样艾灸方法选择一定的腧穴与一般的体表点，其作用是明显不同的。
2、经络腧穴对药物作用的放大性经络并不是一个简单的体表循行路线，而是多层次、多功能、多形态的调控系统。在穴位上施灸时，影响其多层次的生理功能，在这种循环感应过程中，它们之间产生相互激发、相互协同、作用叠加的结果，导致了生理上的放大效应。
3、经络腧穴对药物的储存性腧穴具有储存药物的作用，药物的理化作用较长时间停留在腧穴或释放到全身，产生整体调节作用，使疾病得以治愈。
调节免疫功能作用
许多实验都证实灸疗具有增强免疫功能的作用。灸疗的许多治疗作用也是通过调节人体免疫功能实现的，这种作用具有双向调节的特性，即低者可以使之升高，高者可以使之降低，并且在病理状态下，这种调节作用更明显。
药物本身的药理作用
灸疗的用药情况，虽比不得内治法丰富，但从各种隔物灸及太乙、雷火针灸在临床应用的情况看也可窥灸疗辨证论治之一般。特别值得一提的是，灸疗主要原料艾的功能。
清代吴仪洛在《本草从新》中说：“艾叶苦辛，生温熟热，纯阳之性，能回垂绝之亡阳，通十二经，走三阴，理气血，逐寒湿，暖子宫，止诸血，温中开郁，调经安胎，……以之艾火，能透诸经而除百病。”可以毫不夸张地说，离开了艾，灸疗学就不存在了。
