主要症状：
生殖器疱疹HSV感染后平均约4～5日，外阴患部先有灼热感，旋即发生成群丘疹，可为一簇或多簇，继之形成水疱。数日后演变为脓疱，破溃后形成糜烂或浅溃疡，自觉疼痛，最后结痂自愈，病程约2～3周。皮损多发于男性的包皮龟头冠状沟和阴茎等处，偶见于尿道口；女性则多见于大小阴唇阴蒂阴阜子宫颈等处，亦见于尿道口。原发性生殖器疱疹，往往伴有全身不适，低热头痛等全身症状，局部淋巴结肿大。本病常复发，复发性生殖器疱疹较原发者轻，损害小，往往无全身症状。男性同性恋可出现肛门直肠HSV-2感染，其发病率仅次于淋球菌所致的肛门直肠炎，临床表现为肛门直肠疼痛便秘分泌物增加和里急后重，肛周可有疱疹性溃疡，乙状结肠镜检常见直肠下段粘膜充血出血和溃疡。
原发性生殖器疱疹临床表现：
潜伏期2-10日，平均为6日。发病部位男性为包皮龟头冠状沟阴茎。偶可见于尿道前列腺和精囊，同性恋者可发生于肛门直肠；女性则为外阴大小阴唇阴蒂阴道宫颈，也可发生于肛门直肠及尿道。原发性感染的症状往往比较严重，水疱出现前接种部位常先有灼热瘙痒或感觉异常，女性白带增多，随之局部出现淡红色斑或丘疹，在此基础上迅速出现芝麻至绿豆大群集性紧张水疱，疱液开始较清，逐渐可变成混浊甚至程脓性。疱壁较薄，易破溃形成溃疡面较大，自觉疼痛，触动后更明显。
复发性生殖器疱疹的临床表现：
常发生于原发性生殖器疱疹后1-3个月内。由HSV-2感染引起者复发率较高，发作的频率也较高。第1次感染后1年内约60%的患者复发，第1年的发作次数为4-6次，有些多达10次以上。复发性生殖器疱疹的症状，比原发性生殖器疱疹轻。复发性生殖器疱疹可合并骶骨神经根病：表现为臀部或股部疼痛或感觉异常尿潴留阴茎不能勃起等。其它合并症还有直肠炎前列腺炎尿道炎综合征等。妇女发生宫颈癌的危险性比一般妇女大5-10倍。
人是单纯疱疹病毒的唯一自然宿主。发作期恢复期患者，以及不显症状的所谓健康带菌者为本病的传染源。主要通过病损处的水疱疱液唾液及粪便中存在的病毒进行传播。本病主要通过性行为传染，通过被污染物品的间接传染较少。此外，患生殖器疱疹的母亲，在分娩过程中，经过产道可将病毒直接传染给新生儿，或怀孕过程中患病，当机体抵抗力低时，病毒可通过胎盘传给胎儿。某些因素如情绪激动发热月经来潮性行为等，使潜伏于神经节内的病毒活化后沿周围神经下行至表皮细胞引起局部病损。
