包括全身及生殖器官检查。全身检查与内科方法相同，特别要注意发育、营养及精神状况，但重点则是生殖器官的检查，检查内容包括：
1、阴茎：注意有无严重的包茎、硬结、炎症用肿瘤或发育异常。
2、尿道；有无瘘孔、下裂、硬结。
3、前列腺：经肛诊可检查其大小，有无硬结、肿物，还可按摩取前列腺液检查。
4、睾丸：测量其大小、触诊硬度，有无硬结、压痛、肿物，是否为隐睾。
5、精索：触摸其中输精管的硬度，有无结节、压痛，有无精索静脉曲张。
三、实验室检查
除将精液检查列为必查项目外，其余要视患者具体情况进行选择：
1、精液分析：此举有助于了解男性生育力，是不育症的必查项且，检查内容包括色、量、液化时间，酸碱度、精子计数、活动力、存活率及形态。
2、体外异种授精实验：即使常规精液分析完全正常，但有时仍不能完全代表精子的授精能力。体外异种授精实验可更准确地估计精子的受精能力，对判断男子生育力极具价值，常用者是人精子穿透仓鼠卵子的异种授精实验，以正常生育者的精子作为对照。
3、前列腺液检查：正常为乳白色、偏碱性，高倍镜下可见满视野的微小、折光的卵磷脂颗粒，少许上皮细胞、淀粉样体及精子，白细胞数大于十，有炎症时白细胞数目增加，甚或见到成堆脓细胞，卵磷脂颗粒显著减少。
