在制作工艺上，面巾纸和卫生纸都是原生纸浆制作，均经过消毒程序。相比较而言，面巾纸的用纸要求要高一些，其明确规定不得使用回收的废纸，因此价格也较高，但对于添加物没有明确规定。
为了使面巾纸手感好，在水中不易折断，其中添加了湿强剂、柔软剂，还有荧光增白剂、活性剂、纸粉、香味剂等化学物品，而卫生纸中就没有这些添加物。面巾纸用来擦脸擦手没问题，但如果用来当卫生纸擦拭女性私处，就很有可能引起过敏。如果添加了工业用的滑石粉，则有可能引起外阴和阴道炎症，对身体健康极为不利。
建议，不同用途的生活用纸最好分开使用，餐巾纸用来擦嘴，面巾纸用来擦脸擦手，卫生纸用在私密部位等，不要混用。另外，最好选正规厂家生产的面巾纸，还要注意认准卫消证号等信息。
