中药品种复杂，存在同名异物、同物异名的现象，易造成中药滥用、混用而中毒，再加上其性味功能各异，成药的每个品种也有不同厂家生产的不同品牌，而不同品牌的产品在质量疗效方面也存在一些差异，甚至相差甚远。
动物个体方面
不同的动物对药物的反应存在个体差异，一是免疫学方面的差异，二是年龄、性别方面的差异。中药的过敏反应中有许多是由于动物本身具有过敏性的体质，它们在正常剂量或小于正常剂量的情况下即可发生严重的过敏反应。
给药方式方面
主要包括给药途径的影响和配伍不当，中药注射剂主要采用两种方式给药，即静脉注射和肌肉注射。两种方式都未经消化道细胞的选择吸收，是机体对药物的另一种被动吸收，所吸收的成分种类多而复杂，许多对机体有害的物质直接进入体内，增大了不良反应的概率，从临床使用情况来看，中药注射剂发生过敏反应多而且重，但口服煎剂的反应小。
另外，疗程和剂量使用不当也是产生中药不良反应的主要原因之一，剂量不同，功效各异，药物的药性在一定条件下可由量变导致质变。此外，长期使用会使体内药物蓄积过多而中毒，也易成瘾。
不良反应的预防
重视药材的质量管理
我国《药典》对中药材的采集、加工炮制、储藏等方面均有明确规定与要求，对那些功能、主治尚不明确的中草药，特别是代用品应严禁使用。
坚持辨证论治
中药是在中医药理论指导下，用于防病、治病的药物，组方应注意用量和配伍禁忌，更应坚持因品种而异、个体化原则，才能达到有益无害的治疗目的。
