然后精气流在意念导引之下，上至璇玑穴，向左臂而下，至曲池, 经内关逆掌以及指尖，出手臂至手臂外关，上肘逾肩井，上大椎而下，出尾闾。
由下复上，过玉枕，达昆仑泥丸至面部，过鹊桥，降重楼，经胃口过脐，至玉柱，复到气海，行于右腿，历膝关，穿足背至趾间转涌泉踵后，上运过阴谷，通过尾闾，复至顶门。
如前下鹊桥，依次到左腿，如循右腿经脉一样，下落涌泉，贯尾仓而下摄元海，如上真气循经贯注一周。
大周天炼气化神即把在小周天中炼成的丹母送进十二经脉、奇经八脉，将它炼成精、气、神三宝合一，能量无比的 “ 大药 ” 。
内丹炼化精气，应掌握一阳之气生发的天然时机，于 “ 正子时 ” 起身炼精，采药归炉，此为产大药之时，亦即大药完成的生理信号。《仙佛合宗》说：须知大药生时，六根先自震动。这时丹田火炽，两肾汤煎，眼吐金光，耳后风生，脑后鹫鸣，身涌鼻搐一类，为得药之景，所得即为大药，这一时刻即叫 “ 正子时 ” 。
“ 正子时 ” 是与小周天功法中 “ 活子时 ” 相对的内丹术语。 “ 正子时 ” 中的 “ 炉鼎 ” 与小周天 “ 炉鼎 ” 不同。小周天以下丹田为 “ 炉 ” （大炉），上丹田为“鼎”（大鼎）；大周天以下丹田为 “ 炉 ” （小炉），中丹田为 “ 鼎 ” （小鼎）。
当大周天正子时采药入炉升鼎后，所用火候，更以 “ 绵密寂照 ” 为上乘功法。其法，就意念言，最要心中寂寂观照，常定常觉，听凭中丹田和下丹田鼎、炉里的 “ 大药 ” 上浮下沉，氤氲灵活；就呼吸言，亦须一任自然往来，密密细细，沉而调匀，来不得半点儿的粗急。如此日久功深，待至神气成 “ 圣胎 ” ，就可过渡到 “ 上关炼神还虚 ” 的最后阶段了。
内丹功法精气运行的过程称为 “ 河车搬运 ” 。河车分为小河车、大河车、紫河车。小河车为元气从肾传肝，从肝传心，从心传脾，从脾传肺，从肺传肾的五行循环，周而复始， “ 龙虎交战 ” 而变 “ 黄芽 ” 的过程。
大河车为元气从尾闾开始，历经督脉的下、中、上 “ 三关 ” ，任脉的下、中、下 “ 三田 ” ， “ 抽铅填汞 ” 而成 “ 大药 ” 的过程，亦即 “ 小周天 ” 收功、 “ 大周天 ” 起始
四、炼神还虚
炼神还虚为上关，又称九年关。是内丹修炼的第四阶段。
炼神还虚为道教全真修炼法最高境界，有融合儒、释、道之妙。
炼神还虚的 “ 虚 ” 指超越语言思虑，与道合为一，与宇宙同体，入于虚空，故在丹经中常以 “ ○ ” 代虚。所谓 “ 九年 ” ，借用佛教禅宗达摩面壁九年的典故，以喻此阶段纯入性功，常定常寂，一切归元。
这一阶段，应将意守的重点由中丹田转到上丹田泥丸宫。以天地宇宙为 “ 鼎 ” ，以上丹田为 “ 炉 ” 。其时炉中自守，主要为由 “ 大药 ” 而化成圣胎的 “ 婴儿 ” 。 “ 婴儿 ” 需要哺乳、抚养、训练，故而对于此时一连串的功法，纯由意想而成，以达 “ 出神 ” 而趋于物我同化、常定常寂、一切归元的目的。
