当然以上针法也有其局限性。比如其针法只能按时开穴，并且要选择气血旺盛的经脉或穴位来针刺，而不能去调动整个人体的气血去推动疏通病变部位的经脉。若想运用针法先补足人体元气，再去导引元气疏通局部经脉，起到治标又治本的效果，尚须用子午流注针法。此针法在临床实践中取得明显疗效。子午流注针法是针灸之术中的一种高级古典针法，小而言之，为针灸的一种配穴方法，大而言之，则根源于五运六气，概括了整个祖国经典医学理论体系于其中，故可喻为“大则弥论宙宇，小则纤悉秋毫”的一种高级针法。在子午流注针法中纳甲法与纳子法互相辉映，使人体十二经脉流注气血与自然界周期现象相配合，达到治病的更好疗效。
运用此针法打通任督二脉，不仅能够治愈顽疾，无病也能益寿延年，也为丹家培元筑基打下扎实的根基。而且越年轻其效越明显。因为年轻，精气神三宝充足，命基坚固，而已婚之人多属亏损之体，三宝不足，命基动摇，因此须先培补肝肾之气，待其元气充足。医道上按仙道，医道是仙道之基础，故有“未学道，先学医，医道同源”之说。而筑基培元之法唯针道最捷，正如《标幽赋》所述“拯救之法，妙用者针”因药补不如食补，食补则不如气补，通过针法来培养激发先天之气，是最高层次的补法，也是从后天返回先天之过程，因此针法运用到最高境界即是与丹道相结合达到了针即是道的境界，故曰针道。道家针法之奥妙，则非现代学院派所能理解领会的。因此针灸之法不仅能治愈顽疾，而且对培元筑基皆有最直接显著之效，共最高成就是打通任督二脉，完成炼精化气，为修道者打下扎实的命功基础。
