感染性肾结石除有通常肾结石的表现外，还有它自身的特点。感染性结石生长快，常呈大鹿角状，X线平片上显影，常伴有持续的或反复发作变形杆菌等致病菌的尿路感染史。在结石裂隙内，甚至在结石核心，都藏有致病菌，抗菌药物不易达到该处而难以消灭它们，停止抗菌药物治疗后，这些幸存的细菌又死灰复燃，引起复发。
如手术取石后仍有残余碎石遗留，则很快又长成鹿角状结石，因结石不易取净，尿路感染不能消除，以致这种结石复发率较高，终因结石并发梗阻和感染导致肾功能受损，还可继发肾出血，甚至因此行急症肾切除术。此类病人尿呈强碱性，镜下常有脓细胞及红细胞，尿培养有细菌生长。
感染性肾结石可能长期存在而无症状，特别是较大的肾结石。较小结石活动性大，小结石进入肾盂输尿管连接处或输尿管时，则引起剧烈的蠕动，以促进结石的排出，于是出现绞痛和血尿。
