成年妇女的阴道粘膜伸展性大，腔内湿润，内含少许乳白色稀糊样物，系由阴道粘膜所脱落的上皮细胞及所渗出的少量液体和宫颈粘液混合而成。阴道粘膜上皮为复层鳞状上皮，其细胞形态随卵巢分泌的雌激素的影响而改变。当月经周期中雌激素由少增多时，由阴道脱落细胞发生相应变化。
阴道粘膜中最基础的细胞为底层中的内基底细胞，形小而圆，胞浆染成深蓝色，胞核大而松，胞浆边缘与胞核直径之比为1：1.最成熟的细胞为表层中的角化细胞，形大而方为多角形，胞浆色红，胞核小而致密，胞浆边缘与胞核直径之比为20：1。实验室检查根据阴道脱落细胞涂片中角化细胞所占百分率，可算出角化指数（CI）；按表层细胞致密核所占百分率，可算出致密核指数（KI）；按底层、中层、表层细胞在总脱落细胞中分别所占百分率，可算出成熟指数（MI）。临床上常根据上述指数估计体内雌激素的水平。
此外，阴道尚有自净作用，这是因为阴道粘膜受雌激素的作用合成糖原，此糖原经乳酸杆菌分解后产生乳酸，使阴道呈酸性（PH约为4-5），部分抑制细菌生长。
