首先要根据体质情况及所需的养生要求选好穴位，将点燃的艾条或艾炷对准穴位，使局部感至有温和的热力，以感觉温热舒适，并能耐受为度。
施灸时一般是先灸上部，后灸下部、腹部；先灸头身，后灸四肢。如不讲灸法次序，先灸下部、后灸头部，患者常出现面热、咽于、燥等症。施灸时要注意安全，防止燃烧的艾绒燃火或脱落，烧损皮肤或衣物。
艾灸时间，可在3～5分钟，最长到10～15分钟为宜。通常，健身灸时间可略短，病后康复施灸的时间可略长；春、夏二季，施灸时间宜短，秋冬宜长；四肢、胸部施灸时间宜短，腹、背部位宜长，老人、妇女、儿童施灸时间宜短，青壮年则时间可略长。
施灸后，局部皮肤出现微红灼热的属正常现象，无需处理，很快即可自行消失。若出现水泡，小者可自行吸收，大者可用消毒毫针刺破放出水液，再涂以獾油或龙胆紫，并以消毒纱布包敷。瘢痕灸后，可在局部盖以消毒敷料，以防止摩擦，预防感染，保护痂皮。若并发感染，灸疮有黄绿色脓、液或有渗血现象，可用消炎药膏或玉红膏涂敷。
对颜面、五官和有大血管的部位，不宜采用瘢痕灸；对孕妇的腹部和腰骶部也不宜施灸。这些就是施灸的禁忌。
