五是秧苗管理。水稻苗期管理根据秧苗生育特点，可分为扎根冒青前后、三叶期前、三叶期后三个阶段。种谷落田后进行塌谷，撒上复盖物，保湿保温，随着芽鞘伸长，第一片不完全叶冒青，接着从芽鞘内伸出第一片完全叶，同时芽鞘口发生不定根，秧苗开始扎根竖苗。此时，秧苗呼吸旺盛，需氧量大，秧田灌水要严格掌握，晴天满沟水，阴天半沟水，既要保持秧板湿润，又不能使水满上秧板。否则，水分过多空气不足，秧苗迟迟不扎根，甚至出现烂芽倒苗现象，由于幼苗抗寒力强，即使遇到一般低温，也不要灌水上秧板。
秧苗冒青扎根至三叶期前，从自养生长（利用种子贮藏的养分进行生长）逐步过渡到异养生长（利用自身光合作用产物生长），抗寒力弱，如冷热不当，肥水失调，根系活力减低，吸收能力减弱，体内营养不能自给，就会引起青枯或黄枯死苗。为了有利于保温和满足秧苗伸长时对水分的要求，晴天可灌薄水上秧板，天雨放干沟水，遇到强冷空气，要灌半腰水护苗，回暖期勤换水。二叶一心期，及时施用“断奶肥”，提高秧苗素质。
三叶期后，要灌浅水上秧板，稀播长秧令要及时追肥，促进分蘖，拔秧前4天左右，施好“起身肥”。
早稻薄膜覆盖育秧，膜内和膜外温差很大，管理不当，容易引起死苗。秧田管理要特别注意调节好温湿度，一般出苗之前保持密封状态，出苗以后遇晴暖天气，要严格掌握膜内温度，如超过30度就要两头通风，如温度继续升高，就要掀开薄膜中段甚至揭开一半通风，必须注意晴暖天气通风要在上午8—9点膜内外温差较小时开始，切忌在中午温度增高时骤然揭膜，以免卷叶青枯，导致死苗。通风必须结合灌水，一般要先灌水后揭膜。此外，薄膜覆盖育秧还要注意防止雨后积水压膜和大风掀膜，提倡搭低架地膜覆盖。
