全身性症状
1、神经症状：如失眠、头痛、乏力、眩晕、眼发黑、出汗、神经兴奋性增强、肌腱反射亢进等较为常见。
2、甲状腺机能失调：曾有人发现部分（15.5%）蓝氏贾第鞭毛虫病患者的甲状腺机能有改变，其中以甲状腺机能亢进占大多数，基础代谢增高16%~20%,部分患者可增高30%,因而也会产生甲状腺机能亢进的症状。
胆道系统症状
蓝氏贾第鞭毛虫在胆道系统寄生，可以引起胆囊炎及胆管炎。主要症状为上腹部疼痛、食欲不振、消化不良、恶心、嗳气、胃部烧灼感、肝脾肿大、有压痛，进食油腻时加重，有时可出现黄疸。
三胃肠道症状
1、十二指肠炎型：有似十二指肠溃疡样疼痛，伴有纳差、低血压等。X线检查多显示球部变形，甚至有溃疡征。抗虫治疗后可以消除上述症状。
2、急性或慢性阑尾炎型：症状与一般阑尾炎相似。切除的阑尾，呈炎性病变，粘膜有时可见溃疡，绒毛间可发现大量滋养体。
3、结肠炎型：主要症状有腹部钝痛，阵阵加剧，伴恶心、呕吐、腹泻，常被误诊为痢疾。
4、直肠乙状结肠炎型：与一般直肠乙状结肠炎同。用乙状结肠镜检查，可见弥漫性充血、水肿、严重者有圆形溃疡，溃疡表面覆有渗出性假膜。拭子检查可见大量滋养体。无特殊病理改变。
四、贾第虫病的防治原则：
消除传染源以积极治疗病人和无症状带囊者为主。加强人和动物宿主粪便管理，防止水源污染。搞好环境卫生、饮食卫生和个人卫生。托儿所和幼儿园儿童共用的玩具应定期消毒。艾滋病人和其它免疫功能缺陷者，均应接受防止贾第虫感染的预防和治疗措施。常用治疗药物有甲硝唑（灭滴灵）、呋喃唑酮（痢特灵）、替硝唑、巴龙霉素多用于治疗有临床症状的贾第虫患者，尤其是感染本虫的孕妇。
