使人健忘
人的记忆力好坏与体内的高密度脂蛋白胆固醇(HDL，俗称好胆固醇)水平有关。HDL水平高，记忆力就好，反之亦然。反式脂肪酸会降低体内的高密度脂肪酸水平，提升低密度脂肪酸水平，因此，摄入反式脂肪酸的人尤其是老人更容易记忆力下降。
致人发胖
一项调查发现，膳食中反式脂肪越高的人，在同样食量下，肥胖危险就更大，且脂肪主要会堆积在腹部，内脏脂肪也会增加。经过计算，同样的数量，反式脂肪酸对肥胖的催化力是脂肪总体平均效应的7倍，是饱和脂肪的3至4倍。也就是说，吃反式脂肪让人增肥的效果尤其强，吃1口反式脂肪，等于吃7口普通油脂或是吃了4口肥肉。
引发冠心病
2006年，一份反式脂肪酸相关研究报告指出，即便只摄取极低量的反式脂肪，也会大幅提高罹患冠心病的风险。美国每年因冠心病死亡的人当中，有3万至10万人归因于食用反式脂肪。反式脂肪酸会令好胆固醇水平下降，令坏胆固醇水平上升，使血管发生堵塞，增加冠心病的风险。
导致血栓形成
反式脂肪酸有增加血液黏稠度和凝聚力的作用。实验证明，摄食占热量6%的反式脂肪酸的人群，其全血凝集程度比摄食占热量2%的反式脂肪酸人群有所增加，因而使人容易产生血栓，对于血管壁脆弱的老年人来说，危害尤为严重。
