种植的灵芝根部是没有沾泥或腐木根的，商贩常把根部剪掉，因为种植的灵芝是在伐倒的野木上凿一个孔，然后才把灵芝子种进去，所以，长大后摘下来的灵芝是不沾泥也不沾有腐木的（当然，有些人为了整洁美观好看，也常把野生灵芝的根部剪掉）。
此外，种植的灵芝，8公分以上的，边缘也常有一轮黄色（中间呈黑色），而野生的则没有这种现象。
如果野生灵芝在幼嫩时被虫蛀过,会使许多其它多孔菌混杂其中,不仅没营养，而且有害，应注意剔除。
对于成朵形的原木灵芝子实体，一般可以从形体、色泽、厚薄、比重上判定其好坏。
野生灵芝和人工栽培灵芝的鉴别 用手用眼鉴别
好的原木灵芝子实体，其朵形呈圆形或肾形，柄短，肉厚，其菌盖的背部或底部，用放大镜能看到有管孔的部位，一般呈淡黄色或金黄色为最佳，呈白色则其次，呈灰白色、且管孔已经较大的最差，这种灵芝子实体的营养已大量转化为孢子粉喷射完毕，其药力也大打折扣。
蒸过的灵芝与未蒸过的灵芝如何鉴别：
有些无良商贩常将野生灵芝蒸过一次或二次后，再拿来出售，这样的灵芝，营养大打折扣甚至没有营养。
蒸过的野生灵芝表面看与一般野生灵芝无异，但仔细观察，蒸过的灵芝，表面较干净，无光泽，茎或菌面较油腻，手触摸有“沾”、油的感觉；而未蒸过的野生灵芝，表面通常沾有泥尘，比较有光泽，手触摸光滑，无沾粘感。
