男方支原体、衣原体感染如果做精液支原体培养呈阳性，说明支原体和精子黏附在一起的，治疗原则是支原体转阴才能要孩子。一般，中西医结合治疗 1~2周后，停药一周，复查精液支原体培养，结果呈阴性的话，再等一个月(让药物充分代谢)，才能要孩子。男方查出衣原体感染，90%以上的妻子也会感染。
由于支原体、衣原体感染比较顽固，女患者从治疗到怀孕差不多需要半年的时间。治疗前，可以先做药敏试验，看看红霉素、阿奇霉素等哪种药物更对症，治疗效果会更好。通常，10天为一疗程，须连续治疗3个月经周期(每个月经周期，治疗一疗程)，再连续3个月经周期经前或经后1周左右复查宫颈分泌物，倘若结果都呈阴性，就能怀孕了。
