中医认为，菠萝具有清热解渴、消食消肿等功效，可以用于辅助治疗消化不良、水肿、小便不利等疾患。李时珍在《本草纲目》中记载菠萝能“补脾胃，固元气，制伏亢阳，扶持衰土，益气，宽痞，消痰，解酒毒，止酒后发渴，利头目，开心益志”。
菠萝含有一种叫“菠萝朊酶”的物质，它能分解蛋白质，帮助消化，溶解阻塞于组织中的纤维蛋白和血凝块，改善局部的血液循环，稀释血脂，消除炎症和水肿，能够促进血循环。尤其是过食肉类及油腻食物之后，吃些菠萝更为适宜，有助于预防脂肪沉积。菠萝蛋白酶在胃中可分解蛋白质，补充人体内消化酶的不足，对消化不良的患者有一定的帮助。此外，菠萝还有一定的利尿作用。由于菠萝中的植物纤维素的作用，对便秘治疗也有一定的疗效。菠萝富含维生素B1，能促进新陈代谢，消除疲劳感。
菠萝虽然营养美味，但患有湿疹和疥疮的人不能吃菠萝。菠萝中含有一种生物甙及菠萝蛋白酶，会刺激口腔黏膜，食用后使人感觉口腔涩痒；其菠萝蛋白酶会使某些人食后过敏，因此，吃鲜菠萝时最好削皮切块，用盐水浸泡半个小时左右之后食用，避免过敏。
