国家先后三次开展了全国中药资普查，对中药资源开展了一系列整理与评价、保护与生产的专项研究，在中药材道地性等方面有理论创新，衍生出分子生药学、中药资源化学、中药资源生态学等分支学科，并创新了一些新技术新方法。
然而，由于鉴别困难、盲目移栽或栽培不当、土壤等原因，目前中药材还存在以假乱真、品质下降、濒危短缺、遗失被盗等问题，要解决其中的关键环节，让中药品质得到保证，并能持续利用，同时加大知识保护。
为此，建议在中药资源保护利用的规划布局上，加强中药资源体系规划，分析中药资源分布和栽培区域变化，建立国家中药资源自然保护区和中药材种子种苗基地，建设种质库、种苗繁育基地、标本库等以国家中药资源中心为主的体系。加强中药品质辨识和品质形成研究。通过编研《中药药用生物红皮书》，开展中药资源动态监测方法研究、种质资源保存方法和标准化研究、基因资源的生物技术保护研究、产区土壤修复等，促进中药资源持续利用。此外，要调查药材的遗传资源及传统知识信息，开展药材现状、趋势及管理对策分析，提出药材管理及传统知识保护的对策。
