1、疫苗因素
研究发现，按0、1、6个月免疫程序接种疫苗，产生抗体的滴度与注射疫苗的剂量、种类等相关。此外，与疫苗的保存也有关系，如保存方法不当可致疫苗失效。
2、机体因素
相关研究表明，排除检测试剂因素，一半以上无或弱免疫应答者本身为乙型肝炎病毒感染者。疫苗接种后是否产生抗体，与机体本身的免疫功能关系密切，患有艾滋病等免疫缺陷疾病，或是由于恶性肿瘤、糖尿病等疾病导致免疫功能低下，或长期使用免疫抑制剂等情况，都会降低机体对疫苗接种的抗体应答。研究还表明，含某种基因或有某些不良生活习惯的人，对乙肝疫苗的免疫应答也较差。
3、接种因素
实验证明，接种部位以上臂三角肌最优，臂部其他部位的接种效果则较差，这是因为除上臂三角肌外，其他部位的脂肪较厚，接种后可影响疫苗对体内免疫细胞的刺激。经大量人群实验证明，目前使用的0、1、6个月的免疫程序效果较好。
