上官婉儿曾经还和相貌不俗的武三思有过私情。后来，为了保住武氏家族日渐衰微的地位，也为了武家和李家能够像武则天所希望的那样世世代代交好下去，她作出了一个决定：要武三思去伺候韦后。
经过上官婉儿这一穿针引线，很快便促成了“好事”。后来，得益于武三思的加入，韦后在朝中的势力大增。此后，中宗的权力也几乎被架空了。
武三思在得到韦后和安乐公主等人的支持后，相继设计贬杀了张柬之、袁恕己、桓彦范、敬晖和崔玄韦五王，韦后也渐渐有了武则天在武后时期的气焰。此后，上官婉儿为了保住武三思的地位，在所草拟的诏令中，经常推崇武氏而排抑皇家，她的这种行为引起了太子李重俊的强烈不满。
那是在景龙元年七月，李重俊与左御林大将军李多祚等联合，假传圣旨，调用左御林军及精骑三百多人，夜半时分，兵分两路直扑武三思和武崇训的府第。一鼓作气诛杀了武三思及其亲党十几人，接着，他们又带着这些士兵，直奔肃章门，想要铲除韦皇后、安乐公主和上官婉儿。
上官婉儿得知了这个消息后，急忙前往中宗和韦后的住处商量对策。她对两人说道：“看太子这架势，是要先杀我上官婉儿，而后再杀皇后和皇上。”韦后和中宗听后又惊又气，在内殿来回踱步。但是，此时的当务之急是找个地方躲避。
于是，高宗和韦后带着上官婉儿和安乐公主登上玄武门躲避兵锋，命令右羽林大将军刘景仁率两千多名骑兵，守在太极殿前，把城门关得严严的。
太子的三百多人并不是高宗军队的对手，结果兵败被杀。中宗下诏将太子首级献上太庙。韦后见武三思死了，心中又悲又恨。后来，她听说太子首级到京后，马上下懿旨：“将太子首级，在三思、崇训父子柩前致祭。”韦皇后和安乐公主亲自到灵前吊奠。此时的武三思也可以安息了，有堂堂一国之母为自己报了仇。
大概是受到了大唐开放思想的影响，上官婉儿也喜爱彰显自己的才能。于是，她建议中宗设立修文馆，招揽天下才子。同时，她还邀请朝中能书会写的大臣进入修文馆，一起舞文弄墨。且多次赐宴游乐，醉不思归。
上官婉儿博学多才，还多次代替中宗、韦后和安乐公主作诗咏赋，诗句优美，被当时的人竞相传唱。中宗赏识上官婉儿的才华，并将大臣们所作的诗，交给她一一评定，排名第一者的，常有加官晋爵的机会。
一时间，在朝廷内外，吟诗作赋之风极为盛行。韦后没有好的文采，既然有上官婉儿的捉刀代笔，而各文臣又是心照不宣，于是，对韦后也是一味地进行称赞。中宗和韦后顿时也感觉十分有面子，于是对她便更加宠爱了。
上官婉儿借此机会，成功将身为兵部侍郎的崔湜变成了自己的人。从此以后，才子佳人便惺惺相惜。崔湜年少多才，俊朗体贴。上官婉儿觉得他们两个是天作之合，现在结成了露水情缘，也算是称了自己的心意。
但是，上官婉儿唯一感到遗憾的是崔湜在宫外，而她却在宫内，虽然对于他们来说，宫闱不是个大问题，但是，终究有个中宗在上面，行动也是极为不方便的。
上官婉儿苦思冥想，终于想出了一个掩人耳目的好办法，即请求营建外第，以方便游乐。中宗派人在上官婉儿居住地，营假山、建池塘，穷极雕饰，常常邀请大臣到这里游玩助乐。这里亭台轩榭，绿水环绕，是洛阳最为有名的风雅之所。
但是与此同时，这个地方也成了上官婉儿和崔湜的安乐窝。从此，两人如胶似漆。当然，崔湜也借由上官婉儿的关系，得了不少的好处。后来，他又把自己的弟兄崔莅、崔液、崔涤四人都介绍给了上官婉儿。
从此，上官婉儿行走坐卧，四兄弟形影不离。她常常在宫中设宴，与四兄弟饮酒作乐，行令赋诗。后来，崔湜在主持铨选时，犯了很多错误，御史李尚隐实在看不下去了，便上书进行弹劾。
朝廷没办法，便将崔湜贬为了外州司马。上官婉儿哪里肯让他在外受苦，于是，联合太平公主为其求情，崔湜便官复原职了。此后，为了更好地保护崔湜，上官婉儿把他让给了太平公主。
景龙四年六月，中宗被韦后和安乐公主毒死后，上官婉儿和太平公主一起草拟遗诏，立温王李重茂为皇太子，并于三天后即位，是为唐殇帝。
此后，韦后主掌天下事务，而唐殇帝却形同傀儡，实权均在韦后的手中。后来，临淄王李隆基率领羽林将士杀进宫中，将韦后及其党羽一起消灭了。
上官婉儿知道这次带兵的是李隆基，便知道自己活不长了，因为在上官婉儿在院内与武三思发生私情时，被李隆基看见了。李隆基下决心说：“有朝一日，我定会杀了这个女人。”
于是，上官婉儿秉烛出迎。各位官兵在奔波劳顿了一天之后，见到如此恬静的美景，不觉都愣了。有人想要代为求情，却被她给拒绝了。她说李隆基来了，自己也该走了，于是便自杀身亡了。
